A maioria dos animais expostos, em uma área de 700 m², pertence à fauna tropical e foi taxidermizada ou embalsamada há mais de 50 anos. Na entrada, há informações sobre as atividades dos docentes e pesquisadores do Museu. Os animais são agrupados conforme sua classificação: peixes, anfíbios, répteis, aves e mamíferos, e invertebrados como corais, crustáceos e moluscos. A Biblioteca, especializada em Zoologia, tem instalações e equipamentos modernos, com patrimônio de 73.850 volumes, sendo 8.473 livros, 2.364 títulos de periódicos, além de teses e mapas.