Desvendar a complexa estrutura das proteínas é uma tarefa essencial tanto no estudo dos processos biológicos quanto na indústria farmacêutica e, de forma mais específica, na análise dos resultados pós-seqüenciamento de DNA de qualquer genoma. Para conhecer e interpretar melhor a complexidade dessas moléculas, muitos dos pesquisadores da área já estão usando um conjunto de softwares desenvolvido pelo Núcleo de Bioinformática Estrutural (NBI) da Embrapa Informática Agropecuária, de Campinas, uma das unidades da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária.
O novo conjunto de ferramentas, chamado de Gold Sting Suite ( sequence to and within graphics ou seqüência dentro de gráficos-GSS), faz uma análise tridimensional das proteínas que ajuda os pesquisadores a compreender todo o engenhoso funcionamento molecular, incluindo aspectos como a formação de substâncias candidatas aos principais componentes na preparação de novos fármacos e defensivos agrícolas.
‘O produto está disponível no Protein Data Bank (PDB), ou Banco de Dados de Proteínas, no San Diego Supercomputer Center (SDSC), o maior banco de dados de estruturas de proteínas do mundo, na Universidade de San Diego, e na Universidade de Columbia, ambas nos Estados Unidos.
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Samuel Antenor – Agência Fapesp
